在该报告中，科学家们被要求做出更多努力，以确保通过测序获得的基因组不受污染，并从公共基因组数据库中检测基因组的潜在污染。
“基因组污染是一个大问题，但它不是一个新问题，”加州大学进化生物学家和美国能源部联合基因组研究所系统发育基因组学项目负责人说。"这篇论文可能有助于提醒人们这个问题."
污染可能在测序的任何阶段被引入基因组序列。有可能是空气中的细菌掉入了样品中，或者是灭菌后试剂中残留了DNA片段。但是最常见的污染原因可能是科学家自己，例如在扩增前将他们自己的细胞放入样本中。
“研究人员戴手套进行实验操作不仅可以保护自己，还可以防止样本被自己污染，”该论文的作者之一、康涅狄格州大学的分子遗传学家说。
O' Lab的一个大学生在基因组数据库中筛选保守序列时，兴奋地发现大量物种之间存在着相同的序列。然而，当他试图在实验室重复这些结果时，他失败了。这位学生不禁开始质疑数据库基因组是否存在污染，于是他与实验室的同事合作，筛选了四个公共数据库(数据库、NCBI数据库、数据库等)中存储的所有非灵长类动物基因组。)为人类特定重复序列的Alu元素。
在搜索到的2057个原始基因组中，研究人员发现其中454个被人类Alu元素序列污染，占总数的22.39%。“我们发现污染程度高到足以引起人们的注意，”奥尼尔说；“而这只是来自人类的污染。我可以想象大肠杆菌等常见实验室物种造成的污染有多大。”
艾森指出：“已有大量论文报道了物种间的横向基因转移，但现在人们不禁怀疑这是否仅仅是人类DNA污染数据造成的。人类污染的频率会要求科学家完成一些超标的实验来确认自己的实验结果。”
“当涉及到人类测序时，高度的序列污染可能会导致严重的后果，”奥尼尔说。“在鱼样本中找到铝元素非常简单。然而，很难找到另一个人类样本。按照这样一个高度污染的顺序来决定个体化治疗的策略，可能会导致难以想象的悲剧。”
“随着研究的不断推进，科学家必须在质量控制上投入更多的资金。然而，在追求研究数据的压力下，质量控制的重要性被抛在了后面，”艾森说。“如果每个人都能意识到数据质量的重要性，那就太好了，但目前似乎很难做到。”
(Biolink:何强)
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